Modelización molecular

En este trabajo, se describió en términos energéticos la estabilidad del péptido homotrimérico T3-785, un modelo representativo del colágeno humano, utilizando la técnica de fraccionamiento molecular con tapones conjugados (MFCC) y en el ámbito de la teoría funcional de la densidad (DFT). Fue posible predecir la relevancia individual de los aminoácidos Pro, Hyp, Gly, Ile, Thr, Gly, Ala, Arg, Gly, Leu y Ala, la consiguiente importancia de las tríadas Pro-Hyp-Gly, Ile-Thr-Gly, Ala-Arg-Gly y Leu-Ala-Gly y, por último, la influencia de las zonas N-terminal, Central y C-terminal de cada cadena en el mantenimiento de la integridad de la triple hélice de colágeno. Para ello, se calcularon las fuerzas de atracción y repulsión de los 90 residuos que componen el sistema. Cada uno de estos residuos tenía una energía de interacción que variaba en función de la naturaleza química de su cadena lateral, del entorno de microsolvación que lo rodeaba y de los contactos intermoleculares que establecía. El estudio pionero de la estabilidad conformacional en términos energéticos de una región libre de iminoácidos fomentará la investigación centrada en el desarrollo y síntesis de colágenos artificiales de alta estabilidad por Bioingeniería.