Modélisation moléculaire

Dans ce travail, la stabilit? du peptide homotrim?rique T3-785, un mod?le repr?sentatif du collag?ne humain, a ?t? d?crite en termes ?nerg?tiques ? l'aide de la technique de fractionnement mol?culaire avec capuchons conjugu?s (MFCC) et dans le cadre de la th?orie de la fonctionnelle de la densit? (DFT). Il a ?t? possible de pr?dire l'importance individuelle des acides amin?s Pro, Hyp, Gly, Ile, Thr, Gly, Ala, Arg, Gly, Leu et Ala, l'importance cons?quente des triades Pro-Hyp-Gly, Ile-Thr-Gly, Ala-Arg-Gly et Leu-Ala-Gly, et enfin l'influence des zones N-terminale, Centrale et C-terminale de chaque cha?ne dans le maintien de l'int?grit? de la triple h?lice du collag?ne. Pour ce faire, les forces d'attraction et de r?pulsion des 90 r?sidus qui composent le syst?me ont ?t? calcul?es. Chacun de ces r?sidus poss?de une ?nergie d'interaction qui varie en fonction de la nature chimique de sa cha?ne lat?rale, de l'environnement de microsolvatation qui l'entoure et des contacts intermol?culaires qu'il ?tablit. L'?tude pionni?re de la stabilit? conformationnelle en termes ?nerg?tiques d'une r?gion libre d'acides iminiques encouragera la recherche ax?e sur le d?veloppement et la synth?se de collag?nes artificiels ? haute stabilit? par bio-ing?nierie.